はてなアンテナみたいなものは、要は単なるブックマークなんだから、別に非公開で使っていても全然問題ないし、誰が使っているのかをたどる手段も必要ないと思う。

たまたまtDiaryでははてなアンテナからのREFERERは表示されているけど、それを言ったらいわゆるブラウザのブックマークとかローカルファイルからのリンクだってリファラーを（残す場合は）残すわけだし、そういうのを（tDiaryとか多くのアクセス解析プログラムが）非表示にしているように、はてなアンテナからのREFERERも同じ類だと割り切ってしまう方がいい。

確かにアクセス制限された領域からのREFERERが残っていると、ちょっと気持ち悪い（どういう風にリンクされているのか気になる）けど、別にそれはリンクする（閲覧する）側のプライバシー情報ってことで、別に公開を迫る必要はないと思う。