決定版とか言っておきながら、まだいじっている。セクションアンカーの文字列長を、ちゃんと@confから持ってくるようにした。これで曖昧な部分がなくなったんじゃないでしょうか。

23,29d22
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<         if (highlightElem.tagName == 'H3') {
<           var diary_title = "#{@conf.html_title.gsub(/"/, '\\"')} (#{@date.strftime('%Y-%m-%d')})";
<           var sanchor_length = #{@conf.section_anchor.gsub(/<[^>]+?>/, '').length};
<           var section_title = highlightElem.innerHTML.replace(/<[^>]+?>/g, '').substr(sanchor_length);
<           document.title = section_title + ' - ' + diary_title;
<         }